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Lepers_33001500_2020.pdf
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- Durant sa formation, la thyroïde doit acquérir une forme spécifique pour remplir sa fonction. Une phase cruciale est la transition d’un amas de cellules jusqu’à un ensemble de follicules, composé chacun d’une monocouche de cellules polarisées et d’une lumière, le colloïde. De nombreux mécanismes jouent un rôle important dans cette transition, comme la polarisation des cellules, l’invasion de vaisseaux sanguins et la génération de lumière. Le travail réalisé lors de ce mémoire a été de modéliser différents processus : la polarisation des cellules épithéliales, la génération des lumières ainsi que l’amélioration de l’invasion de l’amas par les vaisseaux sanguins. L’implémentation de ces mécanismes a fait apparaître des paramètres dont la sensibilité a été investiguée. Des images obtenues par microscopie en fluorescence ont été analysées avec comme objectif d’en tirer des grandeurs utiles, qui ont été comparées par la suite aux simulations du modèle. Ces comparaisons ont permis de calibrer dans une certaine mesure les paramètres du modèle. Le résultat de ce travail a été entre autres une simulation de 96 heures de développement embryonnaire. Les conditions initiales, ont été basées sur des images de microscopie en fluorescence. Les situations intermédiaire (48h) et finale (96h) de la simulation ont été comparées aux images obtenues au temps de développement respectif. Le modèle a été capable de représenter l’invasion des cellules endothéliales et la génération des lumières. Cependant, il nécessite encore des modifications afin d’obtenir une fragmentation de l’amas représentative de la réalité observée. La modélisation a été réalisée à l’aide de CHASTE, une librairie C++ et les analyses d’images ont été conduites avec HALO.