Impact de métabolites de biocontrôle bactériens et de leur combinaison avec un champignon mycorhizien à arbuscules sur le contrôle de "Rhizoctonia solani" chez la pomme de terre : étude "in vitro" et "in planta"

Details

Supervisors

Declerck, Stephan ; Calonne, Maryline

Faculty

Faculté des bioingénieurs

Degree label

Master [120] : bioingénieur en sciences agronomiques, à finalité spécialisée

Abstract

frDans un contexte d’agriculture durable, la réduction de l’usage des pesticides est une priorité. Ainsi, il est impératif de trouver des moyens de gestion durables des phytopathogènes notamment grâce au biocontrôle. Ce mémoire de fin d’études s’inscrit dans cette démarche. Il explore le potentiel de biocontrôle des métabolites secondaires produits par "Bacillus velezensis" GA1 et "Pseudomonas" sp. ainsi que de la symbiose avec le champignon mycorhizien à arbuscules (CMA) "Rhizophagus irregularis" contre "Rhizoctonia solani", pathogène majeur de la pomme de terre. L’effet antagoniste direct des métabolites bactériens a d’abord été évalué "in vitro". La bacilysine est apparue comme le principal métabolite antifongique et la fengycine comme le seul lipopeptide purifié inhibant directement la croissance de "R. solani". En revanche, les rhamnolipides n’ont montré aucun effet et la surfactine a stimulé la croissance de "R. solani" à forte concentration. La combinaison du filtrat de la souche sauvage GA1 de "B. velezensis" et de la symbiose avec "R. irregularis" "in planta" n’a pas engendré d’effet significatif systématique sur la biomasse ou la sévérité des symptômes causés par "R. solani" sur pommes de terre. Cependant, une tendance à la réduction des symptômes a été relevée pour les plantes associées au CMA et traitées avec le filtrat. Les températures élevées et les attaques de thrips ont pu masquer d’éventuels effets. Enfin, l’impact des filtrats de "B. velezensis" sur "R. irregularis" a été évalué. Seul le filtrat de la souche sauvage GA1 de "B. velezensis" non dilué a significativement inhibé la germination des spores du CMA "in vitro". Cependant, aucun effet négatif du filtrat bactérien n’a été constaté "in planta" sur la colonisation racinaire des pommes de terre par "R. irregularis", ce qui confirme l’innocuité des métabolites sur le CMA dans le sol. Ce travail souligne l’intérêt de certains métabolites de "B. velezensis" contre "R. solani" et le potentiel de combiner plusieurs agents de biocontrôle, bien que leur efficacité dépende fortement des conditions expérimentales. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour préciser leurs effets, évaluer leur impact sur la biodiversité microbienne du sol et mieux comprendre les interactions entre bactéries et champignons bénéfiques.