Implication du transposon TnXax1 dans la diversification et propagation des facteurs de virulence chez Xanthomonas citri

Details

Supervisors

Hallet, Bernard ; Bragard, Claude

Faculty

Faculté des bioingénieurs

Degree label

Master [120] : bioingénieur en chimie et bioindustries

Abstract

Xanthomonas citri pathovar citri (Xcc) A306 est l’agent causal du chancre des agrumes chez les Citrus spp. sensibles, l'une des maladies les plus graves de la citriculture, qui cause de graves pertes sur le plan économique. Xcc utilise des protéines effectrices sécrétées par un système de sécrétion de protéines de type III pour coloniser ses hôtes. La famille d’effecteurs la plus importante et la plus étudiée est la famille de « Transcription Activator-Like Effector » (TALE). Les protéines TALE sont transmises au noyau de la cellule végétale hôte, où elles agissent comme des activateurs de transcription, contribuant ainsi directement à la pathogénicité. Les TALEs sont retrouvés chez toutes les bactéries Xanthomonas et constituent une caractéristique clé dans la pathogénicité de ces espèces. Récemment, des analyses bio-informatique réalisées chez Xcc souche A306 ont révélé l’existence d’une structure pouvant correspondre à un transposon fonctionnel de la famille Tn3 dans le plasmide pXac64, nommé TnXax1. Ce dernier porte des gènes de transposase, de résolvase et de recombinase, le tout flanqué par une paire d’IR correspondant à l'IR terminal hautement conservé des transposons de la famille Tn3. Le transposon TnXax1 serait impliqué, du moins chez Xcc pathotype A et d'autres espèces étroitement apparentées, dans la diversité des gènes TALE ainsi que la propagation des principaux gènes de pathogénicité et de virulence. Les hypothèses émises dans cette étude bio-informatique se basent sur le fait que TnXax1 serait toujours fonctionnel. Nous avons alors développé un test de transposition afin de vérifier l’activité de transposition de TnXax1. La première partie de ce travail a été consacrée à la construction des outils pour TnXax1, dans le but de faciliter sa manipulation dans les expériences. Ces outils ont été conçus de façon à pouvoir être utilisés aussi bien chez E. coli que chez Xanthomonas. Dans la seconde partie, un test de transposition basé sur la conjugaison bactérienne a été réalisé in vivo dans une souche d’E. coli. À l’aide des outils construits précédemment, la transposition de TnXax1 a été caractérisée dans un plasmide cible et dans le chromosome d’une souche d’E. coli. Les résultats obtenus dans ce travail indiqueraient que le transposon TnXax1 ne montre pas d’activité de transposition dans la souche E. coli testée. Ceci peut être dû à diverses raisons, telles que l’absence des protéines hôte nécessaires à la transposition, ou encore à l’inactivité de la transposase de TnXax1.