Étude du transcrit alternatif du gène Argonaute 1, CT-AGO1, caractérisé comme gène « cancer-lignée germinale »

Details

Supervisors

De Smet, Charles

Faculty

Faculté de pharmacie et des sciences biomédicales

Degree label

Master [120] en sciences biomédicales, à finalité approfondie

Abstract

Le laboratoire d’accueil a récemment mis en évidence un nouveau gène, dénommé CT-AGO1, qui appartient au groupe des « cancer-germline genes ». Ce type de gènes est caractérisé par une expression spécifique dans les cellules germinales et une activation aberrante dans les cancers résultant d’un processus de déméthylation de l’ADN. CT-AGO1 est un transcrit alternatif du gène AGO1, qui présente lui une expression ubiquitaire. AGO1 fait partie de la famille des protéines Argonaute, impliquées dans les mécanismes d’interférence ARN. CTAGO1 comporte son propre exon 1, mais ses autres exons sont les mêmes que ceux de AGO1. Il pourrait donc produire une protéine tronquée de AGO1. Les objectifs de ce mémoire sont de vérifier la production d’une protéine par CT-AGO1 et d’étudier ensuite ses fonctions cellulaires. Nos résultats démontrent que le transcrit CT-AGO1 produit différentes isoformes tronquées de la protéine AGO1, à la fois dans un modèle cellulaire (HEK293) où CT-AGO1 est surexprimé et dans des cellules tumorales (U2OS) qui expriment CT-AGO1 de manière constitutive. Des expériences de fractionnement cellulaire et d’immunofluorescence indiquent que les protéines produites par CT-AGO1 se localisent majoritairement dans le cytoplasme, où elles apparaissent dans des structures granulaires. La transfection de siARNs spécifiques dans les cellules U2OS montrent que la déplétion de CT-AGO1 ralentit la croissance de la population cellulaire. Enfin des analyses bioinformatiques confirment la haute fréquence d’activation de CT-AGO1 dans les adénocarcinomes gastriques, et indiquent que l’expression de ce variant est associée à l’hyperméthylation et la répression du promoteur de AGO1 situé en aval. En conclusion, nous avons montré que CT-AGO1 produit des protéines tronquées de AGO1 avec des effets potentiellement oncogéniques. Pour la suite, nous envisageons d’étudier l’impact de CT-AGO1 sur les processus d’interférence ARN, et de poursuivre les investigations sur le rôle de ce gène dans le développement tumoral.