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AILLAUD_Benjamin_83391200_2020-2021.pdf
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- Abstract
- Ce mémoire traite de la vénomique, soit l’étude des venins à des fins d’innovations thérapeutiques. Il est introduit par la présentation de trois exemples de médicaments issus de toxines venimeuses qui ont pu être mis sur le marché. Ces principes actifs sont bien connus en ce qui concerne l’exenatide et surtout le captopril, un peu moins dans le cas du ziconotide. Le corps du mémoire consiste à dresser un tableau global des différentes voies possibles pour une étude systématique des venins. La bio-informatique est au cœur de la démarche, elle permet de regrouper les travaux effectués autour de la génomique, la transcriptomique et la protéomique. Les outils utilisés seront décrits de manière synthétique. Ainsi on décrira comment des méthodes couplées de chromatographie, d’électrophorèse et de spectrométrie de masse permettent d’isoler les peptides d’un venin afin d’identifier leur séquence en acides aminés ainsi que les éventuelles modifications post-traductionnelles participant de leur structure. Ensuite, on étudiera les technologies employées pour la détermination de la séquence en acides nucléiques des gènes codants pour la transcription de ces protéïnes. Au travers d’un exemple, on pourra apprécier comment, du prélèvement d’une glande venimeuse sur un spécimen à l’étude de l’ADN de cette glande, on peut estimer la qualité mais aussi la quantité de peptides exprimés par chez un spécimen, tout en prenant en compte les variabilités intra-espèces qui dépendent de plusieurs facteurs. On continuera le mémoire par la description de méthodes de synthèses de peptide, la description de quelques essais pharmacologiques visant à caractériser leur activité et l’utilisation d’outils informatiques pour analyser, autour des interactions ligand-récepteur, les résidus essentiels responsables de l’activité à des fins d’optimisation. On conclura ce travail par quelques réflexions autour du bien fondé de cette discipline qui prend de l’ampleur mais aussi autour des limites de celle-ci, tout particulièrement en terme de production et de galénique.