Remodelage d'une communauté synthétique de bactéries associées à l'hyphosphère d'un champignon mycorhizien à arbuscules connecté à une plante saine ou malade
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- Face aux pressions environnementales croissantes et à la nécessité de repenser les modes de production agricole, l’étude des interactions entre plantes, micro-organismes fongiques et bactéries offre des perspectives prometteuses pour le développement de systèmes durables. Ce mémoire explore la dynamique d’une communauté microbienne synthétique associée à l’hyphosphère d’un champignon mycorhizien à arbuscules (Rhizophagus irregularis), en fonction de l’état sanitaire de la plante hôte. L’objectif principal est d’analyser la capacité d’une plante à recruter ou non certaines bactéries spécifiques via le réseau d’hyphes extraracinaires de son partenaire fongique, et d’évaluer l’impact d’un stress pathogène sur ce processus de sélection microbienne. Pour ce faire, un dispositif expérimental contrôlé a été mis en place, combinant l’utilisation de communautés microbiennes synthétiques (SynComs), des tests de confrontation in vitro visant à sélectionner et assembler une communauté fonctionnelle, des observations microscopiques destinées à suivre le comportement des bactéries au contact des hyphes. Les résultats mettent en lumière des différences notables dans l’organisation spatiale de la communauté bactérienne selon que la plante est saine ou infectée. Ils révèlent également une asymétrie compétitive fonctionnelle entre les espèces bactériennes étudiées, ainsi que des interactions spécifiques entre bactéries et champignon susceptibles de moduler la croissance fongique et, indirectement, la physiologie de la plante. Ces observations contribuent à une meilleure compréhension des mécanismes de recrutement microbien et ouvrent des pistes pour optimiser l’utilisation des interactions naturelles dans la gestion agroécologique des cultures.