Fragment based drug design

Details

Supervisors

Frédérick, Raphaël

Faculty

Faculté de pharmacie et des sciences biomédicales

Degree label

Master [120] en sciences pharmaceutiques, à finalité spécialisée

Abstract

Au cours des quinze dernières années fragment based drug design s'est montré comme étant une méthode alternative efficace dans le domaine du drug design moderne. Le criblage de fragments est de plus en plus d'actualité, on retrouve de nombreux exemples ayant connu un succès dans la découverte de substances bioactives, il en existe même un médicament connu sous le nom de Vémurafénib entièrement conçu par FBDD. Le principe de base repose sur un criblage de composés de bas poids moléculaire qui généralement ne peuvent se lier qu'avec des faibles affinités sur leur cible biologique. Le FBDD est réputé pour ses nombreux avantages parmi lesquels figure l'avantage des petites molécules (l50daltons) qui forment des interactions de haute qualité avec leur cible. Ces petites molécules sont retravaillées et optimisées afin de concevoir une molécule bioactive de haute affinité et sélectivité. Pour identifier les moindres interactions entre les fragments et leur cible, il nécessite d'utiliser des techniques biophysiques sensibles telles que la résonance magnétique nucléaire, la cristallographie aux rayons X ou encore la résonance de plasmon de surface. Certaines de ces techniques peuvent fournir des informations structurales du complexe fragment-cible ce qui permet l'optimisation et la rationalisation de la méthode. Malgré les nombreux avantages, la conception de molécules bioactives à base de fragment présente également des inconvenants notamment pour son coût élevé des instruments de détection biophysique, le faible débit de criblage et la nécessité d'utiliser des hautes concentrations en fragments pour observer des interactions de faibles affinités (ordre millimolaire). Au long de ce mémoire, j'explique également le principe de base du processus par fragment et je discute des fragments, en quoi ils consistent.