Développement de la production de champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA) en tube et en bioréacteur

(2022)

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Les champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA) sont des microorganismes édaphiques établissant une symbiose avec les racines des plantes. Ils permettent d’augmenter les rendements des plantes cultivées et leur résilience face à de nombreux stress biotiques et abiotiques, ce qui rend leur utilisation en agriculture prometteuse pour réduire l’utilisation d’intrants chimiques (engrais et pesticides). Le développement de produits efficaces à base de CMA utilisables à grande échelle (au champ) passe d’une part par un meilleur partage de ces microorganismes entre les différents acteurs de la recherche et d’autre part par une production en masse de CMA exempts de contaminants (in vitro). Les deux défis précités (distribution et production de masse de CMA) se retrouvent dans ce mémoire dont les objectifs sont de (1) définir les conditions optimales pour la culture de CMA en tubes dans le but d’utiliser ces tubes pour la distribution de CMA sous leur forme symbiotique et de (2) développer la culture de CMA en bioréacteur. Les tests en tubes ont été menés avec des vitroplants de pomme de terre et un CMA modèle (R. irregularis) encapsulé dans des billes d’alginate. Une faible colonisation racinaire et une faible production de spores ont été obtenues, permettant d’envisager ce système pour le partage de CMA sous leur forme symbiotique après des améliorations nécessaires du système. Les tests effectués en milieu liquide dans le but de s’approcher des conditions du bioréacteur ont été réalisés dans des erlenmeyers. La technique testée repose sur la co-encapsulation d’un fragment de racine transformée avec des spores de CMA. La croissance hyphale et racinaire a eu lieu après encapsulation mais aucune colonisation racinaire n’a été observée. La qualité du clone racinaire est remise en question et des pistes d’amélioration du système ont été dégagées avant d’inoculer un bioréacteur.