Caractérisation de la diversité fonctionnelle du microbiote bactérien du puceron du bananier "Pentalonia nigronervosa"

Details

Supervisors

Renoz, François

Faculty

Faculté des sciences

Degree label

Master [120] en biologie des organismes et écologie, à finalité approfondie

Abstract

frLes pucerons entretiennent des associations étroites avec des bactéries symbiotiques qui influencent leur physiologie, leur reproduction et leur capacité vectorielle. Le puceron du bananier "Pentalonia nigronervosa" constitue un modèle biologique d'exception pour l’étude de cette association en raison de la coexistence en son sein du symbiote obligatoire "Wolbachia pipientis", un symbiote rarement observé chez les pucerons. Également, ce puceron est le principal vecteur du Banana Bunchy Top Virus (BBTV), pathogène dévastateur des cultures de bananier en zone tropicale. Cependant, l'hypothèse selon laquelle "P. nigronervosa" puisse aussi agir comme vecteur de bactéries endophytes entre bananiers reste encore peu explorée et c’est dans ce contexte que cette étude a été mise en œuvre pour répondre à cette hypothèse. Pour ce faire, une approche culture-dépendante combinant cinq milieux de culture (TSB, BHI, BCYE, TSASB, DSMZ), deux températures d'incubation (20°C et 25°C) et deux protocoles de préparation des pucerons, avec ou sans stérilisation de surface a été utilisée afin d'isoler et d'identifier la diversité bactérienne cultivable associée à ce puceron. Par la suite, l'identification des isolats bactériens obtenus a été réalisée par séquençage Sanger du gène ARNr 16S et a permis d’identifier 17 espèces bactériennes au total dont 13 ont été retenues comme composantes probables du microbiote de "P. nigronervosa" après analyse discriminante : "Rhizobium sp.", "Microbacterium foliorum", "Arthrobacter sp.", "Pseudomonas sp.", "Brevibacterium sp.", "Curtobacterium sp.", "Streptomyces thermocarb", "Rhodococcoides yunnanense", "Enterobacter sp.", "Pantoea sp.", "Kocuria sp.", "Corynebacterium sp." et "Brucella ciceri." Trois (03) de ces bactéries ont quant à elle été classées comme étant des contaminants potentiels sur base de la littérature et de leur présence dans le groupe contrôle et dont des études ultérieures permettront de confirmer ou infirmer leur classification. Il s’agit de" Micrococcus luteus", "Staphylococcus epidermidis" et "Proteobacteria bacterium". Cependant, en raison d’une suspicion quant à l’isolement de "Wolbachia", identifié sur le milieu BCYE, ce résultat a été préalablement mis de côté en attente de confirmation. Ainsi, plusieurs de ces taxons correspondent à des genres documentés comme endophytes du bananier, suggérant une acquisition possible via l'alimentation phloémienne.