FAM83A comme marqueur de développement précoce du cancer du poumon

Details

Supervisors

De Smet, Charles

Faculty

Faculté de pharmacie et des sciences biomédicales

Degree label

Master [120] en sciences biomédicales, à finalité approfondie

Abstract

Le laboratoire a récemment découvert que le gène FAM83A, qui présente normalement une expression spécifique dans les épithéliums stratifiés, est activé de façon anormale dans les cancers du poumon suite à une déméthylation de ses régions régulatrices. Des analyses CHIP-seq ont révélé la liaison de plusieurs facteurs de transcription à ces régions, connus pour leur rôle dans la différenciation et la régénération pulmonaire, suggérant une associa-tion de FAM83A à ces processus. Ce mémoire vise à élucider le rôle de FAM83A dans cette régénération et à évaluer son potentiel comme biomarqueur pour prédire le risque de cancer du poumon, notamment dans le carcinome épidermoïde pulmonaire (LUSC) et l'adénocarcinome pulmonaire (LUAD). Des données de scRNA-seq ont montré que FAM83A est exprimé dans des cellules impliquées dans la régénération et la différenciation de l'épithélium bronchique. Cette expression au cours de la différenciation a été confirmée par RT-qPCR dans un modèle in vitro de différenciation de l'épithélium bronchique, la culture en interface air-liquide (ALI). Fait notable, une expression accrue de FAM83A a été observée dans des cultures ALI de cellules basales de patients atteints de BPCO, où la régénération et la différenciation cellulaire sont perturbées. Des analyses RNA-seq ont démontré une surexpression de FAM83A dans les lésions pré-cancéreuses de LUSC et LUAD, ainsi qu'une corrélation entre cette surexpression et la pro-gression des lésions de LUSC, renforçant son potentiel en tant que biomarqueur précoce. Des études supplémentaires sur des lignées cellulaires de LUSC et LUAD ont révélé une prévalence élevée de l'expression de FAM83A, indiquant une expression maintenue dans les cellules cancéreuses humaines. Ces observations suggèrent que FAM83A est activé lors des phases de régénération et de différenciation pulmonaires. Notre hypothèse est que des activations répétées de FAM83A, due à une régénération exacerbée, pourraient induire une déméthylation de ses régions ré-gulatrices et une activation persistante, augmentant le risque de transformation maligne. Les futures expériences envisagées incluent la surexpression de FAM83A dans des cellules basales bronchiques et l'utilisation de l'immunofluorescence multiplex pour étudier ses effets sur la différenciation de l'épithélium pulmonaire.